Dostępność ustrojowa ibuprofenu stosowanego miejscowo jest bardzo niska w porównaniu z NPLZ podawanymi doustnie. W przypadku miejscowo stosowanego ibuprofenu działania niepożądane, w szczególności dotyczące układu pokarmowego, występują rzadziej.
Poniższa lista działań niepożądanych odnosi się do działań obserwowanych dla miejscowo stosowanego ibuprofenu w dawkach dostępnych bez recepty (maksymalnie 500 mg na dobę) i podczas krótkotrwałego stosowania. W przypadku leczenia chorób przewlekłych, po długotrwałym leczeniu , wystąpić mogą dodatkowe działania niepożądane.
Działania niepożądane, których występowanie było związane ze stosowaniem ibuprofenu podano poniżej, w podziale na klasy układów i narządów oraz częstość występowania. Częstość występowania definiuje się następująco:
Bardzo często (≥1/10);
Często (≥1/100 do < 1/10);
Niezbyt często (≥1/1000 do < 1/100);
Rzadko (≥1/10,000 do < 1/1000);
Bardzo rzadko (< 1/10,000);
Częstość nieznana (nie można określić na podstawie dostępnych danych).
W każdej grupie częstości występowania, działania niepożądane przedstawione są w kolejności ich malejącej ciężkości.
 Tabela zdarzeń niepożądanych 
| 
  Klasa narządów  
 | 
  Częstotliwość  
 | 
  Działania niepożądane  
 | 
| 
 Zaburzenia układu immunologicznego 
 | 
 Częstość nieznana 
 | 
 Nadwrażliwość  1  
 | 
| 
 Zaburzenia żołądka i jelit 
 | 
 Częstość nieznana 
 | 
 Ból brzucha, niestrawność 
 | 
| 
 Zaburzenia nerek i dróg moczowych 
 | 
 Częstość nieznana 
 | 
 Upośledzenie czynności nerek  2  
 | 
| 
 Zaburzenia ogólne i stany w miejscu podania: 
 | 
 Częstość nieznana 
 | 
 Reakcje w miejcu podania  3  , zmiany skórne (np. zaczerwienienie) i mrowienie w miejscu podania, nieswoiste reakcje alergiczne i anafilaktyczne. 
 | 
| 
 Zaburzenia układu oddechowego, klatki piersiowej i śródpiersia 
 | 
 Częstość nieznana 
 | 
 Astma oskrzelowa, zaostrzenie astmy oskrzelowej i skurcz oskrzeli. 
 | 
| 
 Zaburzenia skóry i tkanki podskórnej 
 | 
 Rzadko 
 | 
 toksyczne martwicze oddzielanie się naskórka, rumień wielopostaciowy 
 | 
| 
 Częstość nieznana 
 | 
 Różnorodne wysypki, pokrzywka, obrzęk naczynioruchowy. 
 | 
 Opis wybranych działań niepożądanych 
 1  Po leczeniu z zastosowaniem ibuprofenu podawanego doustnie lub miejscowo opisywano rzadko reakcje nadwrażliwości. Mogą do nich należeć: (a) nieswoiste reakcje alergiczne i anafilaksja, (b) reakcje ze strony układu oddechowego obejmujące astmę oskrzelową, skurcz oskrzeli lub duszność, lub (c) różnorodne zaburzenia skórne, takie jak wysypki różnego typu, świąd, pokrzywka, plamica, obrzęk naczynioruchowy i - rzadziej - dermatozy złuszczające lub pęcherzowe (włącznie z toksycznym martwiczym oddzielaniem się naskórka, zespołem Stevensa-Johnsona i rumieniem wielopostaciowym).
 2  Po miejscowym zastosowaniu ibuprofenu może wystąpić zaburzenie czynności nerek, w szczególności u osób, u których wcześniej występowały dysfunkcje nerek.
 3  Najczęściej występującymi działaniami niepożądanymi są reakcje w miejscu podania.